с, центр Междуреченского р-на. В XVI – XVIII вв. это Шуйский городок (крепость): «Городок Шуйский словет ростовского митрополита» (Кн. Б. Черт. – ВГВ, 1839, № 44; ВХК, 29). В XVIII – XIX вв. с потерей функций крепости бывшие городки именуются селами или деревнями. В официальных документах XIX в. Шуйское называется уже селом Тотемского уезда (Семенов, V, 823). Название по р. Шуе, притоку Сухоны. Этимология гидронима спорна. Одни считают, что он восходит к древнерусскому слову шуй – 'левый', т. е. Шуя – 'левый приток' (Ф, IV, 484), другие возводят к прибалт.-фин. suo – 'болото': Шуя – болотистая река или река, вытекающая из болота. По свидетельству географов, Шуя действительно вытекает из Замошенского болота (Семенов, V, 836).
Географические названия Вологодской области: Топонимический словарь. — Архангельск: Северо-Западное книжное издательство. Ю.И. Чайкина . 1988.