Заим. в XVIII в. из шведск. яз., где skär — «скалистый остров < скала, утес» — того же корня, что и нем. scheren — «резать». Шхеры — буквально «изрезанные» (берега).
Школьный этимологический словарь русского языка. Происхождение слов. — М.: Дрофа.
Н. М. Шанский, Т. А. Боброва.
2004.